تعتمد حوكمة جمعية مرافئ التنمية على مبادئ الشفافية والمساءلة، وضمان الامتثال للأنظمة واللوائح ذات الصلة. تهدف الحوكمة إلى تنظيم الأدوار والمسؤوليات، وتحسين عمليات صنع القرار، وتعزيز ثقة المستفيدين والداعمين. وباعتماد أفضل الممارسات الدولية في هذا المجال، تسهم حوكمة الجمعية في تحقيق رؤيتها “”تمكين وأثر””، وترسيخ رسالتها في تمكين القطاع غير الربحي من خلال منظومة عمل واضحة ومستدامة.